Евгений Плаксенков получил диплом с отличием в Санкт-Петербургском университете экономики и финансов по специальности «Экономическая кибернетика»; Executive-MBA в Высшей школе экономики; DBA в Международной школе бизнеса Финансового университета при Правительстве РФ; PhD (Doctor of Philosophy in Project and Programme Management) в SKEMA Business School (grande école, France). Обучался в EMLYON (ранее известная как ESC Lyon), SDA Bocconi University, Henley Management College.

Начиная с 1990 года Евгений Плаксенков был соучредителем ряда компаний, разработал более 20 программ акционирования российских компаний, работал директором корпоративных программ Санкт-Петербургского международного института менеджмента (IMISP), HR-директором компании ОТИС-Россия/Восточная Европа (OTIS), финансовым и генеральным директором инвестиционно-девелоперского холдинга МИЭЛЬ, независимым директором в составе Советов директоров нескольких российских и международных компаний.

Евгений Плаксенков присоединился к команде СКОЛКОВО в июне 2009 года.

Евгений входит в список 50 лучших независимых директоров Ассоциации Независимых Директоров России.

Евгений Плаксенков стал номинантом премии «Аристос-2008» в категории «Финансовый директор» и возглавил рейтинговую таблицу Ассоциации менеджеров России и газеты «Коммерсантъ» «Топ-1000 российских менеджеров» в разделе «Профессиональные услуги».

В настоящее время Евгений Плаксенков занимается корпоративным управлением, венчурным бизнесом, консалтингом, преподаванием и исследованиями в области стратегии, финансов, развития проектов и программ.